1．背景值监测点的设置
背景值采样点应设在污染区的外围不受或少受污染的地方。对于新开发区，应在引入污染源之前设背景值监测点。
2．监测井(点)的布设
监测井布点时，应考虑环境水文地质条件、地下水开采情况、污染物的分布和扩散形式，以及区域水化学特征等因素。对于工业区和重点污染源所在地的监测井(点)布设，主要根据污染物在地下水中的扩散形式确定。例如，渗坑、渗井和堆渣区的污染物在含水层渗透性较大的地区易造成条带状污染；污灌区、污养区及缺乏卫生设施的居民区的污水渗透到地下易造成块状污染，此时监测井(点)应设在地下水流向的平行和垂直方向上，以监测污染物在两个方向上的扩散程度。渗坑、渗井和堆渣区的污染物在含水层渗透小的地区易造成点状污染，其监测井(点)应设在距污染源最近的地方。沿河、渠排放的工业废水和生活污水因渗漏可能造成带状污染，此时宜用网状布点法设置监测井。
一般监测井在液面下0.3-0.5m处采样。若有间温层或多含水层分布，可按具体情况分层采样。
采样时间和采样频率的确定
(1)每年应在奉水期和枯水期分别采样测定；有条件的地方按地区特点分四季采样；已建立长期观测点的地方可按月采样监测。
(2)通常每一采样期至少采样监测1次；对饮用水源监测点，要求每一采样期采样监测两次，其间隔至少10天；对有异常情况的井点，应适当增加采样监测次数。
水污染源监测方案的制订
水污染源包括工业废水源、医院污水源和生活污水源等。
在制订监测方案时，首先也要进行调查研究，收集有关资料，查清用水情况、废水或污水的类型、主要污染物及排污去向和排放量，车间、工厂或地区的排污口数量及位置，废水处理情况，是否排入江、河、湖、海，流经区域是否有渗坑等。然后进行综合分析，确定监测项目、监测点位，选定采样时间和频率、采样和监测方法及技术，制订质量保证程序、措施和实施计划等。
采样点的设置
水污染源一般经管道或渠、沟排放，截面积比较小，不需设置断面，而直接确定采样点位；
1．工业废水
(1）在车间或车间设备废水排放口设置采样点监测一类污染物。这类污染物主要有汞、镉、砷、铅的无机化合物，六价铬的无机化合物及有机氯化合物和强致癌物质等。
(2)在工厂废水总排放口布设采样点监测二类污染物。这类污染物主要有悬浮物、硫化物、挥发酚、氰化物、有机磷化合物、石油类、铜、锌、氟的无机化合物、硝基苯类、苯胺类等。
(3)已有废水处理设施的工厂，在处理设施的排放口布设采样点。为了解废水处理效果，可在进出口分别设置采样点。
(4)在排污渠道上，采样点应设在渠道较直、水量稳定，上游无污水汇入的地方。

2．生活污水和医院污水
采样点设在污水总排放口。对污水处理厂，应在进、出口分别设置采样点采样监测。
采样时间和频率
工业废水的污染物和排放量常随工艺条件及开工率的不同而有很大差异，故采样时间、周期和频率的选择是一个较复杂的问题。
由于废水的性质和排放特点各不相同，因此无论是天然水水质还是工业企业废水和城市生活污水的水质在不同时间里也往往是有变化的。采样时间和频率的选取主要也应根据分析的目的和排污的均匀程度。一般说来，采样次数越多的混合水样，结果更加准确，即真实代表性越好。为了使水样有代表性，就要根据分析目的和现场实际情况来选定采样的方式。通常，水样采集的方式有瞬时水样、平均混合水样、平均比例混合水样等。
一般情况下，可在一个生产周期内每隔半小时或1小时采样1次，将其混合后测定污染物的平均值。如果取几个生产周期(如3—5个周期)的废水样监测，可每隔两小时取样1次。对于排污情况复杂，浓度变化大的废水，采样时间间隔要缩短，有时需要5—10分钟采样1次，这种情况最好使用连续自动采样装置。对于水质和水量变化比较稳定或排放规律性较好的废水，待找出污染物浓度在生产周期内的变化规律后，采样频率可大大降低，如每月采样测定两次。城市排污管道大多数受纳10个以上工厂排放的废水，由于在管道内废水已进行了混合，故在管道出水口，可每隔1小时采样1次，连续采集8小时，也可连续采集24小时，然后将其混合制成混合样，测定各污染组分的平均浓度。
我国《环境监测技术规范》中对向国家直接报送数据的废水排放源规定：工业废水每年采样监测2—4次；生活污水每年采样监测2次，春、夏季各1次；医院污水每年采样监测4次，每季度1次。